Hace aproximadamente diez años, las hermanas de la Comunidad de Carmelitas Descalzas de Quito se propusieron compartir su patrimonio con el mundo, mostrando su historia y herencia cultural, dando como resultado la creación del museo del Carmen Alto.
La conceptualización de este espacio inició a fines de 2012, el mismo que estuvo a cargo de la Fundación de Museos de la Ciudad. Para abril de 2013 el Instituto Metropolitano de Patrimonio comenzó la intervención arquitectónica, conservación y restauración de los bienes que fueron donados por las madres para crear este espacio.
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